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技術文章 / article
【連載-企業參考品】 前列腺癌的診斷參考品的選擇
原載自:www.mr-eacltd.com[技術資料頻道] 2020-10-15 瀏覽次數:1331
科佰生物作為(wei) 一家提供企業(ye) 核酸診斷標準品的企業(ye) ,在該領域已經深耕多年,與(yu) 全國該領域90%的企業(ye) 都有過合作,成功支持過很多企業(ye) 的試劑盒研發和獲批,在該領域有豐(feng) 富的經驗。根據我們(men) 對市場的調研,對客戶需求的理解,我們(men) 把我們(men) 的產(chan) 品線劃分為(wei) 多個(ge) 模塊,主要為(wei) 支持PCR的單點mutation、fusion和CNV產(chan) 品,支持NGS的小panel和大panel(泛腫瘤、包含TMB和MSI)產(chan) 品,支持IHC和Fish的FFPE block產(chan) 品,支持標準品定標的dPCR檢測試劑盒產(chan) 品等。
接下來的幾期,我們(men) 陸續會(hui) 針對不用的腫瘤,遵循NCCN指南的標注,為(wei) 大家分享我們(men) 對企業(ye) 參考品選擇的看法。
前列腺癌是指發生在前列腺的上皮性惡性腫瘤。2004年WHO《泌尿係統及男性生殖器官腫瘤病理學和遺傳(chuan) 學》中前列腺癌病理類型上包括腺癌(腺泡腺癌)、導管腺癌、尿路上皮癌、鱗狀細胞癌、腺鱗癌。其中前列腺腺癌占95%以上,因此,通常我們(men) 所說的前列腺癌就是指前列腺腺癌。2012年我國腫瘤登記地區前列腺癌發病率為(wei) 9.92/10萬(wan) ,列男性惡性腫瘤發病率的第6位。發病年齡在55歲前處於(yu) 較低水平,55歲後逐漸升高,發病率隨著年齡的增長而增長,高峰年齡是70~80歲。家族遺傳(chuan) 型前列腺癌患者發病年齡稍早,年齡≤55歲的患者占43%。
針對前列腺癌的診斷,寫(xie) 入NCCN和專(zhuan) 家共識的主要的還是HRR(homologous recombination repair)基因的胚係和體(ti) 係突變,另外還有微衛星不穩定性(microsatellite instability,MSI)和DNA錯配修複缺陷(DNA mismatch repair deficiency,dMMR)檢測,還有一些未明確的基因。
HRR相關(guan) 基因
對於(yu) 初診未進行風險評估、極低風險至中風險的前列腺癌患者,其家族史的獲得及遺傳(chuan) 谘詢是檢測前的必要步驟:對於(yu) 具有明確相關(guan) 家族史、已知家族成員攜帶胚係致病基因突變的上述風險級別患者,推薦進行DNA損傷(shang) 修複相關(guan) 基因(特別是BRCA2、BRCA1、ATM、PALB2、 CHEK2、MLH1、MSH2、MSH6、PMS2)的胚係變異檢測;對於(yu) 家族史不詳的上述風險級別患者,需要結合臨(lin) 床特征進行遺傳(chuan) 谘詢後綜合判斷 是否有必要進行相關(guan) 檢測。對於(yu) 高風險、*風險、局部進展及轉移性前列腺癌患者,推薦進行DNA修複基因(特別是BRCA2、BRCA1、ATM、 PALB2、CHEK2、MLH1、MSH2、MSH6、 PMS2)的胚係變異檢測。
針對HRR相關(guan) 的基因,科佰生物推出多款相關(guan) 的標準品:
錯配修複基因
回顧性研究發現,錯配修複基因突變型前列腺癌患者的臨(lin) 床和病理學特征更具侵襲性。國外研究報道,前列腺癌患者中dMMR及MSI-H患者 比例為(wei) 2%~5%。另有研究報道,約3%的前列腺癌 患者攜帶MSH2(2%)、MLH1(1%)、MSH6(1%)及PMS2(<1%)基因體(ti) 細胞變異,攜帶上述基因突變的患者往往具有很高的總體(ti) 基因突變數量。在中 國316例前列腺癌患者中,攜帶MSH6、MSH2基因 胚係致病變異的患者比例均為(wei) 0.63%,未發現攜帶 MLH1、PMS2基因胚係致病變異的患者。
《NCCN指南》推薦局部進展、轉移性及mCRPC患者進行MSI-H及dMMR檢測,如確診為(wei) MSI-H或dMMR型,mCRPC患者可在特定治療階段考慮pembrolizumab治療(2B類),同時需要進行遺傳(chuan) 谘詢及考慮林奇綜合征(Lynch syndrome)的相關(guan) 基因檢測,進一步的MMR基因胚係變異檢測可以明確其遺傳(chuan) 性改變規律。
科佰基因推出多對MSI的檢測標準品:
其他基因
HOXB13基因:《費城共識》提出需要對與(yu) 遺傳(chuan) 性前列腺癌相關(guan) 的HOXB13基因進行檢測(共識 率95%),主要突變為(wei) G84E和G135E。
RB1基因:近期多項研究發現,RB1基因突變或缺失對mCRPC患者具有重要的預後預測價(jia) 值,在mCRPC中,RB1基因突變或缺失與(yu) 更差的生存期及阿比特龍或恩雜魯胺更短的治療時間有關(guan) 。
AR基因:AR基因擴增/配體(ti) 結構域變異(比如AR-V7)也與(yu) 前列腺癌阿比特龍及恩雜魯胺敏感性降低相關(guan) 。
TP53基因:TP53突變也與(yu) 前列腺癌阿比特龍及恩雜魯胺敏感性降低相關(guan) 。
FOXA1基因:FOXA1是與(yu) AR受體(ti) 通路相關(guan) 的重要基因,FOXA1高表達與(yu) 前列腺癌的不良預後相關(guan) 。近的一項對208例局限期前列腺癌患者的研究發現,41%的中國患者攜帶FOXA1突變,遠高於(yu) 既往西方發達國家患者的比例。並且中國患者FOXA1突變絕大部分為(wei) 熱點突變,可能通過調節AR通路促進前列腺癌的發生、發展。
這些基因相關(guan) 的標準品,我們(men) 都在開發中,歡迎谘詢…
綜上,按照NCCN的指南,按照臨(lin) 床的藥物,按照伴隨診斷的需求,科佰生物開發了針對前列腺癌的各種參考品、標準品,適合不同的應用,滿足不同客戶的需求。
標準品選擇好了,接下來就是做性能評價(jia) ,讓我們(men) 先學習(xi) 下指導原則,對於(yu) 性能評價(jia) 的規定。
詳見《從(cong) 《指導原則》中分析參考品盤設計》。