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技術文章 / article
【產品推介】MSI標準品
原載自:www.mr-eacltd.com[技術資料頻道] 2021-04-01 瀏覽次數:2071
微衛星不穩定性(Microsatellite Instability,MSI),是指由於(yu) 在DNA複製時插入或缺失突變引起的微衛星(Microsatellite,MS)序列長度改變的現象,常由錯配修複功能(Mismatch repair,MMR)缺陷引起。MS序列,是一些短而重複的DNA序列,一般由1~6個(ge) 核苷酸組成,串聯重複排列,常見類型為(wei) 雙堿基CA/GA/GT或單堿基A/T等。MS序列可以位於(yu) 基因的重要非編碼區,也可以位於(yu) 基因的編碼區,多態性分布於(yu) 整個(ge) 基因組,個(ge) 體(ti) 差異大。MSI現象於(yu) 1993年被Jacobs等人在結直腸癌中*發現,與(yu) 癌症發生有關(guan) ,可以用於(yu) 癌症檢測。
MSI檢測方法
MSI常由MMR基因突變及功能缺失導致。因此,在檢測癌細胞中的MSI時,既可以通過檢測MMR基因缺失來確定是否發生MSI,如依賴於(yu) 免疫組化技術的蛋白水平檢測,也可以直接檢測MSI的序列變化,如PCR(聚合酶鏈反應)檢測等的分子水平檢測。
(一)免疫組化方法
免疫組化方法(Immunohistochemistry, IHC):采用免疫組織化學方法檢測腫瘤組織中錯配修複基因MLH1、MSH2、MSH6及PMS2的表達。任何一項錯配修複基因表達缺失,被定義(yi) 為(wei) MSI,否則即為(wei) 微衛星穩定(MSS)。其中一個(ge) 表達缺失則稱為(wei) 低度微衛星不穩定(MSI-L),2種或2種以上蛋白表達缺失為(wei) 高度微衛星不穩定(MSI-H)。
(二)分子水平的檢測
1.聚合酶鏈反應(polymerase chain reaction, PCR)技術
目前主要采用多重熒光PCR結合毛細管電泳的方法。通過PCR方法檢測特異的微衛星重複序列擴增判定MSI狀態,比較腫瘤患者的標本組織與(yu) 正常組織的位點突變情況。其比較的位點為(wei) 美國國家癌症研究所(NCI)推薦的5個(ge) 微衛星位點:BAT25、BAT26、D5S346、D2S123及D17S250。其中≥2個(ge) 位點發生改變判定為(wei) 高度微衛星不穩定(MSI-H),僅(jin) 1個(ge) 位點發生改變判定為(wei) 低度微衛星不穩定(MSI-L),無位點改變判定為(wei) 微衛星穩定(MSS)。有研究認為(wei) ,二核苷酸重複序列的特異性和靈敏度比單核苷酸重複序列要低,因此關(guan) 於(yu) MSI檢測的位點仍存在爭(zheng) 議。Bacher等對266個(ge) 微衛星位點(其中包括單核苷酸、二核苷酸、四核苷酸以及五核苷酸微衛星位點)檢測的敏感性及準確性進行評估,提出了Promega分析係統,該係統使用五個(ge) 單核苷酸微衛星位點(BAT-25, BAT-26, NR-21, NR-24和MONO-27)及兩(liang) 個(ge) 五核苷酸微衛星位點(Penta C和Penta D)檢測MSI。大量的實驗證實,MMR免疫組化檢測結果與(yu) MS的PCR檢測結果有高度關(guan) 聯性,靈敏度92%,特異性可達100%。
2.新一代測序方法(Next Generation Sequencing, NGS)
NGS又稱為(wei) 第二代測序技術,是一種高通量測序技術,能一次性對幾十萬(wan) 到幾百萬(wan) 條基因分子進行序列測定。目前NGS方法已經成為(wei) 檢測MSI的新工具,其優(you) 勢是可以實現多位點高通量檢測。紀念斯隆·凱特琳癌症研究中心(Memorial Sloan Kettering Cancer Center,MSK)的一項研究使用NGS方法對12,288例實體(ti) 瘤病人進行檢測,判定MSI狀態,並用MSI-PCR/MMR-IHC進行了驗證。實驗證明, NGS方法較MSI-PCR方法具有更高的敏感性。
科佰生物可以提供MSI的診斷標準品,保證診斷方法的檢測限、靈敏度、穩定性。
MSS-P1(1.92%) Reference Standard CBP80002-1
MSS-P2 Reference Standard CBP80002-2
MSS-P3 Reference Standard CBP80002-3
MSS-P4(1.92%) Reference Standard CBP80002-4
MSI-H-U1(100%) Reference Standard CBP80002-5
MSI-H-U2(98.08%) Reference Standard CBP80002-6
MSI-H-U3 Reference Standard CBP80002-7
MSI-H-U4(90.38% Reference Standard
CBP80002-8
MSI-H-U5(94.23%) Reference Standard CBP80002-9
MSI-H-U6 Reference Standard CBP80002-10
MSI-H-U7 Reference Standard CBP80002-11
MSI-H-U8 Reference Standard CBP80002-12