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技術文章 / article
子宮內膜癌精準分子分型標準品,助力POLE基因檢測
原載自:www.mr-eacltd.com[技術資料頻道] 2024-04-11 瀏覽次數:1332
2013年美國癌症基因組圖譜(TCGA),依據子宮內(nei) 膜癌全基因組、轉錄組、蛋白組等多組學檢測結果,將其分為(wei) POLE突變型、微衛星不穩定突變型、低拷貝數型和高拷貝數型等4種類型。2023年國際婦產(chan) 科聯盟(International Federation of Gynecology and Obstetrics,FIGO)分期建議,所有的子宮內(nei) 膜癌EC患者均應完善分子分型檢測。
圖1 子宮內(nei) 膜癌分子分型檢測推薦路線
2024年1月29日,美國國立綜合癌症網絡(National Comprehensive Cancer Network,NCCN )同時對結腸癌和直腸癌指南進行了更新,升級為(wei) 2024.V1版本。相比於(yu) 2023 V6版NCCN指南,2024 V1版增加了POLE 和POLD1突變、RET融合基因的分子檢測說明。
POLE基因簡介
POLE 基因位於(yu) 12q24. 33,由63762個(ge) 堿基對組成,包含51個(ge) 外顯子序列,POLE基因編碼 DNA聚合酶 Polε的催化亞(ya) 基,該亞(ya) 基包含催化結構域和核酸外切酶結構域,對 DNA複製過程中的校對功能至關(guan) 重要。當POLE基因的外切酶結構域發生致病性突變、導致該蛋白在 DNA複製過程中無法及時執行錯配校對功能時,腫瘤細胞的基因組會(hui) 在細胞增殖過程中積累大量的複製錯誤,從(cong) 而表現為(wei) 超過正常細胞(通常<10個(ge) 突變/Mb)10~100 倍以上的突變頻率。隻有在腫瘤中檢出位於(yu) POLE基因核酸外切酶結構域(第9~14外顯子)的致病性突變,才能被診斷為(wei) POLE突變型,Pole基因突變可導致腫瘤的發生。
目前研究發現,盡管POLE基因突變的腫瘤形態學高度惡性,但預後良好,對免疫製劑具有良好反應。
POLE基因變異
POLE突變包括體(ti) 係突變和胚係突變,其中體(ti) 係突變率為(wei) 6%~10%,胚係突變率 0.25%~4%,胚係突變具有遺傳(chuan) 性。POLE基因突變類型包括核苷酸的重複、缺失和插入,大多數突變是非整倍體(ti) 。POLE基因突變檢測包括熱點突變或POLE基因核酸外切酶結構域致病性突變。POLE基因核酸外切酶結構域包含外顯子 9~14,80%以上的致病性變異發生在 9號和13號外顯子。目前已確定包括 P286R、V411L、S297F、S459F、A456P、F367S、L424I、M295R、P436R、M444K 和 D368Y 位點在內(nei) 的11個(ge) POLE基因的致病性突變位點。新的可能致病性突變位點正在被陸續報道,少數研究已經證實了外切酶結構域以外的致病性突變,但其致病作用有待進一步證實。
POLE基因檢測
目前POLE基因突變的檢測方法主要包括Sanger測序和第二代高通量測序(NGS)。Sanger測序的優(you) 勢是成本低、精確度高,對於(yu) 已知變異位點的檢測非常經濟和高效,可以作為(wei) 檢測的金標準,但最大的局限性是覆蓋度和靈敏度低,不能檢測到未知變異位點。NGS 技術具有通量大、精準度高和信息量豐(feng) 富等優(you) 點,但由於(yu) 檢測成本高、周期長,限製了NGS在臨(lin) 床實踐中的推廣應用。此外,為(wei) 降低檢測成本並提高檢測靈敏度,還可以對目標序列進行雜交捕獲或擴增子富集後進行靶向測序(targeted sequencing)。2021版《子宮內(nei) 膜癌分子檢測中國專(zhuan) 家共識》推薦條件允許的情況下對POLE基因9~14號外顯子區域進行高通量靶片段測序,尤其是POLE基因核酸外切酶結構域的致病突變。
子宮內(nei) 膜癌精準分子分型標準品
科佰生物推出了子宮內(nei) 膜癌精準分子分型標準品,助力POLE基因檢測。部分數據展示如下:
AI-Edigene® POLE p.S297F Reference Standard Plus CBP10682
AI-Edigene® POLE p.V411L Reference Standard Plus CBP10684
AI-Edigene® POLE p.P286R Reference Standard Plus CBP10685
AI-Edigene® POLE p.F367S Reference Standard Plus CBP10689
AI-Edigene® POLE p.L424I Reference Standard Plus CBP10690